A Proposta Pedagógica da Escola de Educação Especial Raphael Pires dos Santos, enfoca a teoria das INTELIGÊNCIAS MÚLTIPLAS criada pelo psicólogo americano Howard Gardner, o qual define inteligência como, além de ser a faculdade de entender, compreender e conhecer, também é juízo, discernimento, capacidade de se adaptar e de conviver.

Para complementar essa proposta, buscamos desenvolver conteúdos que estimulam oito inteligências múltiplas.  São elas:​​

 Inteligência Lingüística​, Inteligência Lógico-Matemática, Inteligência Espacial, ​intligência musical, Inteligência Cinestésica Corporal, ​​Inteligência Intrapessoal,​ Inteligência interpessoal e Inteligência naturalista.